他立刻率军向高砂城进军，但是黑田官兵卫担心城内兵马会和毛利军联手，有战败的危险，新田义信仔细思考后，认可了这个建议，于是布置了一支兵马防备。
果不其然，在岛津军进攻高砂城的时候，毛利军突然登陆，朝岛津军发起攻击，本多正信连忙领兵杀出，与新田义信夹击毛利军，毛利军立刻撤退。
最后新田义信立刻编组大军发动第二次的攻击，高砂城主梶原景行在城破损没有胜算的情况下，将城兵送入三木城，自己出家改法名为龙庵到刀田山鹤林寺的林中蛰居，放弃了城池。
成功地切断三木城粮道的新田义信，很快又发现毛利的援军从兵库港将粮食运入花隈城，通过丹生山，从澹河城山中的通道将武器和军粮送入三木城的途径。
新田义信立刻发动攻势，将丹生山上的砦烧毁，并将佛教传来的圣地明要寺也一同烧毁。
之后岛津军向澹河城发动攻击，被城主澹河弹正定范用计略大败。澹河弹正定范在作战获胜之后，立刻与一族郎党一起进入三木城笼城，使岛津军上演了一出大兵进攻空城的大失态的表演。
就这样，新田义信将三木城的粮食通道一个一个切断，将三木城的包围圈逐渐缩小。
这时，新田义信发现川中出现许多竹筒。感到不可思议的他命令人调查，发现这些经过三木川流入三木城的竹筒中都装满了米，是胁川的教海寺门信徒将粮食暗中送入三木城中的。
因为岛津军佛门圣地的缘故，他们才会支援别所安治，新田义信因为岛津忠直，也对佛门没有好感，因此立刻派兵将教海寺焚烧，并将僧侣和信徒都抓起来全部杀害，同时将三木城周边的寺院和神社全部都烧毁了。
三木城被岛津军团团包围，虽然粮食不成问题，但是岛津军内铁炮大筒很多，因此新田义信每日让人对着城内射击。
别所安治觉得这样下去不是办法，便与众人商议，澹河弹正定范说道：“别所大人不是得知平田砦是岛津军储藏军粮和军备的地方吗？在下以为可以攻打平田砦，岛津军没了兵粮军备，大军自溃。”
别所安治大喜，当即派人与毛利家联络，很快，毛利家雇佣根来众和杂贺众共八千人出手。
平田砦遭受攻击，新田义信意欲救援，黑田官兵卫连忙说道：“三木城内的别所安治一定不会放过这个机会，必定从后方攻击我军。”
新田义信连忙问道：“很有可能，你觉得如何？”
黑田官兵卫当即献策，让一部分人先行，找个地方躲起来，然后其余兵马继续向平田砦进军。
很快，新田义信就和根来众，杂贺众在平田砦附近爆发大战。
别所安治率领三千精锐出战，遇上黑田官兵卫率领的伏兵，双方一番激战，别所安治败退。
别所势大将格七十余人、士卒八百余人讨死，负伤者无数。经过大村合战后，别所势失去战意，澹河弹正定范一族在加左地方与一族郎党一起自杀。