最容易进行合并的实际上是双方的科研机构，因为只要保密条例和研究权限进行相互确认的话。双方原有的项目组可以在不打算的情况下继续独立的进行研究。
而且某些方向相近，思路相仿的课题也可以合并到一起，起到一加一大于二的效果。
对于研究人员来说，尤其是领到了公会下达死任务的科研人员来说，有的时候得到结果要比一些个人与利益集体之间的争执显得更加重要。
彼此重叠的主要就是一些常规的行政机构。比如说民生部门、后勤部门、猎人公会相关的部门以及农业渔业治安等等公职机构，也就是必要的服务性机构。
这些无论是在水域公会还是在龙柒那里都是存在的。把职能相仿的部门工作守则进行一定程度的合并、归纳、修改之后，就可以较为流畅的投入到新建的工作部门当中。
并且也可以把双方原本的工作人员进行打散重组，这将有利于加快实力融合的过程。
独立的机构主要指的是情报部门，双方之前情报部门只有一小部分是向外探索的，在这部分当中可能得到的内容和执行任务，还有所交叠。
剩下的绝大部分就是对内监视和对对方的势力进行刺探。
而情报机构重组之后，对内监视的部门倒可以变为互相监视甚至共同监视，但是对外刺探就变得大可不必了。
如何把这些互相安插在对方内部的间谍揪出来，然后还要让他们在双方众目睽睽之下体面的拿回自己公会骑士的身份，其实是一件挺扯淡的事情。
但没有办法，两边公会骑士以及公会暗夜的头子均向白夜明表明，如果不需要非常严苛的对内监视政策的话，他们确实想把某些布下的棋子唤醒了。
想让他们回归正常的人生，不要再当二五仔了。
而完全对立机构则是双方此前设立的战备部门，因为在即便当初的冰川之战的时候，双方才刚刚彻底撕破脸大打出手。