当郑芝龙舰队出现在外海，造成了巨大的震动，乱成了一团，许多人都认为是海盗前来洗劫城市了。
郑芝龙是打着大明水师的旗号，但是这年头，兵和贼很难分开，况且这郑芝龙本来就是大海盗，穿上官服没多久，谁敢保证他不会脱下官服，干上一票，捞些外快和打秋谷？
郑芝龙让使者传来了宣战书。
葡萄牙马六甲总督阿齐兹惊得呆了，宣战！开什么玩笑？如果不是郑芝龙的舰队来了，还一字排开，升起了大炮，阿齐兹真的认为，有人是在开玩笑了。
阿齐兹一方面与郑芝龙谈判，另一方面则利用拖延的时间，组织军队准备抵抗。他的部下在内港入口上方的大桥上建立了防御用的栅栏，并在内港聚集起了一支舰队。
同时在马六甲城内的葡萄牙商人蛊惑下，准备对城市内部发起一次特殊的肃反行动，将可能不站在他一边坚持抵抗的非葡萄牙商人一网打尽。这样一来，不仅不少来自印度和东南亚地区的商人可能遭殃，连当时正在港内的十艘大明商船也不能幸免。
阿齐兹派人前来责问：“两国一向友好，为何突然开战？”
郑芝龙道：“你们攻击大明属国吕宋，这是对大明皇帝及大明朝廷的挑衅，必须承受大明的怒火。”
使者诡称：“吕宋还没有建国，大明还没有正式承认吕宋国，所以我等并不算攻击大明的属国。”
郑芝龙道：“这一点你们可以去北京，向大明皇帝陛下申诉，本官奉令攻打马六甲，挡我者死。”
使者道：“我们马上派使者去北京申诉，在此期间，你们不可以发动攻击。”
郑芝龙道：“本官的任务是拿下马六甲，尔等不投降，立即发动进攻，尔等后果自负。”
使者再三劝说，郑芝龙不为所动，只好灰溜溜的走了。
次日，经过大半天等待后的大明舰队发起了第一次攻击，他们几十艘大型战舰一字排开，对城市发动了炮火急袭，炸得马六甲城沙石横飞，烽烟四起。
葡萄牙人的舰队，主力己率贝尔格总督的舰队出征，剩下的小舰队，打打海盗，捉捉走私，维持治安尚可，要对付郑芝龙的大舰队，根本不是对手，才刚交战，他们就被击沉了一半，余者亡魂大冒，逃入了港湾之中，在跨河大桥上的炮台掩护之下苟活。