据其家谱记载，祖籍是陕西扶风，系汉伏波将军马援第三十九代孙马定虎的后裔。马定虎在南宋时因平五溪蛮入境，因功授以石柱安抚使，官职世代沿袭，得以世守石柱。《马氏族谱》、《马氏家谱渊源》、《马氏家谱》均载：马定虎为“迁石柱始祖”，“建业于水车坝”。“其袭爵历元及明无替”。
据《渝州志》云：“宋景定中，蛮酋大虫马什用同向士壁率师大败元兵，继平九溪洞夷，授镇国大将军，领铜牌印、石柱安抚司大使，世守其土。
石柱乃辖东至湖北利川，南接黔江，西界丰都，北邻忠州，广二百十三里，袤二百四十里之广阔地域。
在秦良玉代理土司之前，其马氏内部发生一件争权夺位，引发仇杀之事，万历二十二年，石柱土司妻子代幼子行宣抚事，时土吏马邦聘谋夺其印，与其党马斗斛、斗霖等，集众数千，围秦氏，纵火焚公私庐舍八十余所，杀掠一空。结果，还是马斗斛得了便宜，署理司职，但终究是名不正，言不顺，好景不长，最终下了台。
现在石柱土司是马家和秦家联合掌权时代，马祥麟还没有正式接掌石柱宣抚使之职，秦良玉现为第十三代宣抚使。
在原版，石柱土司在明亡之后又传了十三代，至1949年新中国成立而止，传了五百三十年，二十六代，生命力非常顽强。
米柱连帅将秦良玉扶住，说道：“本官与小马以友相称，如何受得起大人之礼？”
其实马祥麟都比米柱大上几岁，更加老成，算是年少有为，只是遇上了米柱这妖孽上司，全面的被碾压，才被人小马小马的叫，他十六岁独领一军之时，米柱才刚入蒙。
秦良玉道：“米大人乃我马秦两家大恩人，当得起本官一礼。”
米柱说道：“今日乃私宴！只论私交，不论公职。”话虽如此，米柱还是当仁不让的坐上首席，在龙修一战之后，他的官职没有提升，但是威望却是一时无两，在西南无人能及，谁人不知水东宋氏和水西安氏的厉害，但是两家联军被米柱一战而灭，宋氏改土归流，安氏苛苟延残喘，厂卫提督米柱，再次被认为是天下强人，所向无敌。
酒过三巡，菜过五味，米柱道：“秦总兵，本官计划，此间事了，调小马去兵部武选司任郎中，您意下如何？”
秦良玉大为欢喜，这可是天大的好事，多少人盼不到，她连忙道：“全凭大人作主，秦某代马家多谢大人恩德！”她连忙倒了一杯酒，敬了米柱一杯，说道：“大人随意！”
秦良玉有官衔在身，又军衔，向是自称本官或秦某，她地位极高，不会自称贱妾老身什么的。
兵部武选司郎中，除了总兵副总兵之外，参将以下，他都有权挑选任命，别看五品，合金量远高于他这总兵，她向儿子使了一个眼色，说道：“还不敬大人一杯？”
马祥麟忙倒了一杯酒，向米柱一举，一饮而尽，说道：“大人随意！”
米柱道：“本官和小马不来那些虚头巴脑的！”话虽如此，他还是十分给面子一饮而尽。