但是大臣们也相当为难，没有人敢明确反对这件事，这意味着自己是那一个不为民着想的奸臣，人人喊打呀！
没有办法之下，他们只好暂时搁置，留中不发。
对于福藩，现在也不好处理，他确定的罪名是私造龙椅、衮冕，至于炸开黄河大堤袭击河防营的黄河辛酉惨案，目前没有证据与他有关，厂卫掌握的证据，只能说明李无忌和李刚是领头人，至于是不是福藩指使，李无忌没有承认，也没有证据证明这一点。
只是李无忌一个王府长史，没有人指使，他没有必要冒杀头的危险，用这种诛灭九族的大事，获利者是福王，利高者疑。
不过他们不可能像对待李无忌一样对付福王，他毕竞是当今皇室近支之中，辈分最高的亲王，神宗之子，光宗之弟、今上之叔，他们在证据不足的情况下，就可以对李无忌用刑，大刑伺候的招呼，对付他身边的扈从，更是不客气，但对付福王，则不可这样。
朱由校恨福王对他造成了苦难，看不得他在做了这么多事之后还享尽荣华富贵，在消除他的威胁上后，福王无爪无牙，死与不死，反倒是其次的了。
相反，如果福王负上这么一条丧尽天良的罪名，对皇室面子上也不好看，这是一件丢脸之极的事，有损皇室威信。
但是，此事罪行滔天，人神共愤，天地不容，如果福藩真的干了这种事，谁也救不了他，所以朱由校一再向米柱强调，一定要有确凿的证据，没有证据，绝对不允许乱来，他相信这个米柱，明白他的意思。
最是无情帝皇家，不过朱由校并不想如此绝情绝义，在确保自己优势的情况下，得饶人处且饶人，天家人丁单薄，能不自相残杀，尽量不自相残杀。
自孝宗弘治开始，只有武宗正德一子，正德无后，传与世宗嘉靖，嘉靖皇帝活到60岁，共育有8个儿子和5个女儿，嘉靖皇帝的8个儿子只活了其中一个，这存活率低的吓人，嘉靖皇帝其实不想传位给朱载垕，但是无奈没有一个儿子能活过嘉靖皇帝，个个都是短命鬼，如果其他皇子有一个活着也不会出现朱载垕当皇帝这一说，而他五个女儿，也只有一个活过他，只有一子一女为他送终。
穆宗隆庆皇帝朱载垕有四子七女，只有两个儿子，四个女儿送终。
神宗万历皇帝有八个儿子，能为他送终的只有两个儿子（朱常洛、朱常洵）。
光宗泰昌皇帝更惨，七子十一女，能活到现在的只有二子四女，（德公主朱徽妍，母傅懿妃；遂平公主朱徽婧，母傅懿妃；乐安公主朱徽娖，母李康妃；八皇女朱徽姃，母李选侍）。
皇室将一个皇子养活成人，不容易，能留则留吧。