“孤亲娘又该如何自处？孤又该如何自处？”
朱常洛也头痛呀，他的老娘还没有皇后封号呢？而郑妃有皇太后封后，这个福王又该如何？
这个群臣也是宁死不从，祖宗家法岂可因一个之喜好而变？
立国本之争，这么多人被廷杖，这么多人被放逐，尚且不屈服，这个现在，既无廷杖流放之厄，还有讨好新皇，何乐而不为？
如果不是看在皇帝快死的份上，他们不敢上本参斥，全部是跪伏于地，默不作声。
这个皇帝是拟了诣，但是没有内阁附署用印，这只是中旨而不是圣旨。
违抗圣旨就是违抗朝廷权威，杀头诛九族这都是轻的，但这违抗中旨嘛！违抗就违抗了，何况有太子带头呢。
万历皇帝几乎为之气死，但是他知道自己不能死，一死了就中了这帮人的诡计了，他眼睛睁得大大，试图用皇帝权威迫群臣屈服。
首当其冲的，就是内阁首相方从哲。
万历四十年开始，内阁叶向高是一人独相，他上书75次要求增补阁臣，都如泥牛入海。
万历四十一年方从哲出山后，万历似乎找到了理想人选，于是下令立即增补。同年九月，下令从哲与前礼部左侍郎吴道南同加礼部尚书、东阁大学士，入阁为相。
吴道南暂时未入京，因此由方、叶二人辅政。方从哲虽然多年在野，但他因为秉公直谏，敢于对抗宦官，且与朝廷当时的党争牵连较小，在当时声望很高。
次年，叶向高由于老病，请求归家。当时舆论多归于东林人物沈鲤。方从哲于是也投桃报李，追随大流，请求让沈入阁为首相，然而万历不纳。
其间吴道南于万历四十三年终于到京赴任，入参机务，然而旋即在四十五年因为前一年他主持会试时发生的科场舞弊案而自请辞职而去。因此，方从哲在整个万历后期基本上是一人独相，勉强维持国家的运转。
方从哲其实不是坚毅好斗，大权独揽的人，都在莫名其妙的情况下成为了大明首辅，接过叶向高的班，一人独相。
万历皇帝心想：“方卿！朕待你不薄，一个独相，掌管朝纲，此正是回报君恩之时，万历皇帝道：“方卿！此事朕就拜托你了。”