而在某个夜晚吴启哲来到了NERV基地，取走了朗基努斯之枪，而取走镇压莉莉丝身体的朗基努斯之枪之后，即便是只剩下身体没有灵魂的莉莉丝依然开始了暴动。
吴启哲不等莉莉丝的暴动波及周围，便直接把她收回了亚空间。
没有灵魂的躯壳即便在强大也有限，更何况她的力量已经所剩无几。
吴启哲并没有让莉莉丝的身体和凌波丽重新融合在一起的打算，不说会不会引发第三次冲击，这么大号的凌波丽实在让人不知道该怎么相处。
而且谁知道融合了莉莉丝身体的凌波丽，会不会生出某些其他想法，所以为了以防万一，还是让莉莉丝的身体和灵魂分开的好。
至于剩下的朗基努斯之枪吴启哲自然毫不客气的笑纳了。
朗基努斯之枪，也被称为“命运之矛”，具有巨大的力量，能轻易刺穿AT力场。它类似于一种红色的Eva大小的长矛。它在接近中间的地方分岔，两个岔开的轴互相缠绕形成一个螺旋，而整体上是直的。可是当它刺入目标时，它的分裂的两端又再度结合。
长枪最初被用于与亚当的“接触试验”，最后导致这个使徒的苏醒和第二次冲击。长枪从新死海被回收，用于控制莉莉斯。长枪也被用作攻击处于卫星轨道位置并在地面武器或Eva射程范围之外的第15使徒“阿拉尔”的最后武器。在被零号机掷出以后，它摧毁了使徒，但进入了绕月轨道，事实上被NERV所失去。它最后插进了月球的表面。它在“End of Evangelion”中，在第三次冲击发生以前，又从月球飞了回来。长枪在人类补完中是一个关键的部分。
人造版本的长枪被用作量产机的主要兵器，量产系列的作战武器。本身以隆基努斯之枪为模型，并且可以改变其长度与形状。当它穿透AT力场时，前端两叉卷起重合，并突进力场。这把枪曾经刺穿了二号机的力场，接着刺穿了仍在战斗中的二号机，直到二号机完全沉默。这种长枪无法与莉莉丝执行补完计划，但仍拥有与原长枪同等的破坏力。
当然这些情况大多发生在EV版本中，吴启哲所经历的剧场版世界，并没有出现这些情况。
吴启哲用神念和朗基努斯之枪沟通，很快朗基努斯之枪就变成了常人能掌握的大小，看不出来这把枪还通有灵性。
吴启哲握住朗基努斯之枪用系统开始查看，脸上露出一丝满意的笑容，这果然是一把神器，系统给出的力量评级直接达到了S级，这也难怪能镇压重伤之后的莉莉丝，虽然莉莉丝的灵魂已经不在肉体里，但这也足以说明这把枪的不凡。
要知道在原著中虽然失去了灵魂，但莉莉丝肉体的力量依然不可忽视。
原本莉莉丝只有上半身，但朗基努斯之枪被拔去后，开始长出足，而且腹部开始膨胀，有妊娠现象。当她再次觉醒时就会发生第三次浩劫，所有的生命都将回到她体内，变成一个以整体形式存在的生命体。