混元功是郝长风的绝学，也是华山道门的主修功法，却并不是全真一脉所传，而是另有来历。
多年之前，郝长风修道有成，离开全真主脉的时候，并未直接前往华山，创建华山道门，而是漫步天下，把雍州左右万里之内的名山大川都走了一遍，遍访高人隐士，与人比武较技，博取众家之长，补益自身之短。
有一日，他不远万里来到晋州五台山，拜访一位隐居的道士，结果运气不好，这位高人正好出门访友去了，只等无奈而归。
就在他出山的时候，不巧遇到山洪，为了躲避洪水，误入一处山谷，结果在山谷深处，一片蔓藤之下，见到一块残缺的石壁。
石壁上面记载了一篇道家功法，功法极为玄妙，可惜因为石壁残缺，以至于没头没尾，缺了前面入门的部分，也缺少后面高深的部分，只有几层功法，甚至连功法的名称也没留下，只在石壁的一角，刻着“太乙混元祖师”几个字。
郝长风见到这块石壁，顿时被上面博大精深的法诀迷住了。
当下也不离开，就在这座谷里结庐而居，渴饮山泉，饥餐野果，一直在山谷里住了半年多，终于将这篇功法融入自身所学，将原本全真一脉功法推陈出新，成就了自家的独创功法。
初创功法有成，需要起一个名字，郝长风一时踌躇起来。
他虽不知石壁功法的来历，但也不愿贪天之功，抹杀这篇功法原本的来历，便将新创这部功法命名为“混元功”，点出“太乙混元祖师”的身份，作为华山道门的主修功法。
初创的混元功共有四层，分别对应武者修炼的四重境界。
第一重境界便是江湖上所说的外家层次，主要是锻炼肌肉、皮膜，不过，赵拂衣已经晋升内家，前面的基础也打的很牢，这一层功法倒是不必练了。
从第二层开始，直到第四层结束，这三层功法分别是内家、先天和宗师三重境界。
在此之前，由于苍龙门底蕴不深，功法高明有限的缘故，赵拂衣只对内、外两层有所了解，对于内家之上的两重境界，他还是头一次知道。
内家层次锻炼的是人的内脏、神经，这一点他已经清楚。
内家之上是先天，修炼的是人体最深处的骨髓，也是由内而外，重返先天之意，练成之后，便能气血如汞，出手之际，威力无穷。
先天之上则是宗师，修行的是人体最为神秘的脑髓。