八月十五，征夷大将军宣下，秀保正式被任命为征夷大将军，于伏见开幕，史称“桃山幕府”或者“河内幕府”；全国大名前来朝贺，石田三成未曾想自己竟然促成秀保成为武家栋梁，无奈之下只好称病派遣嫡子前去道贺。
庆长十年（1605年）
八月十三，德川秀康病逝，嫡子德川忠直继承结城藩五十三万五千石，根据秀康死前请求，秀保决议将长女淘姬下嫁给忠直。
庆长十三年（1606年）
元月十二，宇都宫国纲病逝，嫡子宇都宫义纲继承宇都宫藩二十五万石，迎娶秀保养女、福井藩主那须资吉长女为正室。
元月二十五日，津轻为信病逝，三子津轻信枚继承弘前藩四万五千石。
庆长十四年（1609年）
五月三日，京极高次病逝，长子京极忠高继承八上藩二十八万石，迎娶秀保养女、三木藩主福岛高吉长女为正室。
五月初，丰臣秀赖晋升为从二位内大臣，然眼疾未愈，性情暴戾跋扈，茶茶数次险些被其砍伤，更有无数侍从死于其刀下，坊间遂称其为“杀生内府”，丰臣氏权威面临外界质疑；
六月初八，听从菊姬建议，秀保以嫡五子河内利国继承大和丰臣氏，再度更名为羽柴利国，统称丰臣利国，继承中南大和三十四万石领地，居城郡山城，史称“郡山藩”
九月二十日，浅野长政病逝，秀保遣人前往悼念，特免除浅野幸长三年参觐交代，幸长感激，以嫡子入侍秀保。
庆长十五年（1610年）
二月，滝川雄利病逝，无嗣，王土奉还，伊势神户藩灭亡。
十月，小仓藩主细川忠兴之父细川幽斋病逝。
十二月，德川氏重臣本多忠胜病逝。
庆长十六年（1611年）
四月初，秀保以庶长子河内光国继承西近江三十六万石，居城坂本，史称“坂本藩”；