自来也猜测对方拥有同样的眼睛，很可能共享视觉，既然忍术和体术无效，那么就只能用幻术了，虽然自来也完全不会用幻术，但两位蛤蟆仙人却可以联手施展强大的幻术蛤蟆临唱，而且这种幻术通过声音传播，轮回眼也无法抵挡。
蛤蟆临唱一举束缚了三个敌人，自来也将他们一一杀死，他以为已经解决了全部敌人，放松了警惕，突然又一个佩恩悄无声息从他身后偷袭，自来也措手不及，断了一条手臂。
此时佩恩六道悉数登场，之前解决的三道也被复活，而自来也失去了左手无法结印，战斗力大损，单手与佩恩六道作战，他依然把畜生道拖入时空结界，用螺旋丸将其干掉。
这时他才发现，这个人是他以前游历世界时遇到过的忍者，两只蛤蟆劝他就此撤退，从长计议，但自来也必须出去确认一件事，如果现在撤退，以后再想接近佩恩就很难了，他再次回到雨隐村，终于确认了佩恩六道的真面目。
这些人竟然全都是他游历世界时遇到的各色忍者，也就是说佩恩六道其实是被操控的傀儡，真正的佩恩只有一人。然而震惊中，自来也被水底的佩恩偷袭，六道同时出手，将自来也直接击败。
自来也终于明白，预言之子并不是长门，而是鸣人，自来也用最后的力量把佩恩的情报写在蛤蟆的背上，在佩恩的攻击中沉入水底，但他露出了如释重负的笑容。
他一直以为自己对“预言之子”的引导失败了，当年没有培养好长门，直到最后也没能阻止佩恩。
但事实上，他把鸣人的父亲培养成了伟大的忍者，所写的书赐予了鸣人名字，同时对鸣人的悉心教导帮助他成长，给了他家人般的温暖，直到最后自来也才意识到，他已经在无意间正确的引导了“预言之子”。
自来也与佩恩的这一战，前半段是占据优势的，击杀佩恩三道时毫发无损，而且看起来查克拉非常充足。从被修罗道背后偷袭，失去手臂开始，战况急转而下。
通过自来也的几次战斗可以发现，他的战斗方式非常正派、传统，依靠结印使用忍术、卷轴使用封印术，不像一些依靠瞳术的忍者只需要瞪眼就能战斗，因此失去一条手臂无法结印的影响非常大，以至于后来只能用单手施展螺旋丸战斗。
如果自来也一开始就知道敌人有六个，没有掉以轻心，恐怕结果会有改变，佩恩后来自己也说不靠这个秘密无法战胜自来也。
但虽然结果会有改变，自来也可能查清佩恩的真面目后用时空忍术全身而退，却并不意味着自来也能够打败佩恩，事实上最强的天道并没怎么出手。
后来仙人模式的鸣人实力已经超越了自来也，但对战佩恩天道时，如果不是雏田挡刀也是要被直接击杀的，更何况自来也对佩恩的情报一无所知，在完全不知道对方战斗方式的情况下只身对敌，而鸣人那时候已经知道了佩恩的大部分情报，并且是以全村之力对敌。
对于自来也的实力如果要做一个比较客观的评价，那应该是截止他死的时候，以当时的战斗力设定，他的实力几乎一人之下，在他死后，大筒木的神仙后代们登场，战斗力跨次元的飙升，自来也就不行了，只能算一个比较厉害的影级强者。
这恐怕也是岸本急于让他谢幕的原因。如果让自来也参与到后期的战斗中，以他前期木叶最强者的定位，难免开出双万花筒卡卡西、八门凯那样的外挂，这对于自来也这种深沉的完美人设来说，显得有些轻浮。
自来也的故事到此结束，之后秽土转生的集体复活也没有让他再次出场，我觉得这是很好的安排，一方面，自来也已经完成了自己的使命，很好的推动了火影的剧情，唯一的遗憾就是与纲手的情感没有挑明，不过这样的一层窗户纸也有朦胧的美感。